Контроль за загрязнением водных объектов – одна и важнейших задач в экологии. Для оценки экологического состояния природных объектов предлагается подход, основанный на диализном культивировании популяций организмов. Известно, что состояние клеток при этом культивировании по ряду аспектов соответствует состоянию организмов находящихся в реальных природных условиях. Внеклеточные метаболиты, сконцентрированные в диализном мешке находятся в условиях, позволяющих обмениваться метаболитами с внешней средой, что позволяет использовать ее для биоиндикации загрязнений природной среды. Решение этой задачи не представляется возможным без использования оптических методов регистрации изменений пространственной организации макромолекул важнейших биополимеров клеток культуры. Решение было найдено в сравнительном исследовании культуры методами спектроскопии в ИК диапазоне. Критерием служили отличия в динамических характеристиках объекта, что соответствовало изменениям загрязнений в водной среде.